Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pggt1bQ8BUY9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Pggt1bQ8BUY9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Pggt1bQ8BUY9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pggt1bQ8BUY9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pggt1bQ8BUY9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms