Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smad3Q8BUN5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smad3Q8BUN5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smad3Q8BUN5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms