Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp4aQ8BU40 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nlrp4aQ8BU40 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4aQ8BU40 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms