Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT42

Smim5, Small integral membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim5Q8BT42 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smim5Q8BT42 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smim5Q8BT42 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smim5Q8BT42 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smim5Q8BT42 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smim5Q8BT42 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smim5Q8BT42 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smim5Q8BT42 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smim5Q8BT42 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smim5Q8BT42 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smim5Q8BT42 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smim5Q8BT42 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smim5Q8BT42 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smim5Q8BT42 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smim5Q8BT42 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smim5Q8BT42 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smim5Q8BT42 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smim5Q8BT42 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smim5Q8BT42 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smim5Q8BT42 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smim5Q8BT42 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smim5Q8BT42 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smim5Q8BT42 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smim5Q8BT42 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smim5Q8BT42 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smim5Q8BT42 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smim5Q8BT42 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smim5Q8BT42 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms