Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ8

Sp8, Transcription factor Sp8, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp8Q8BMJ8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sp8Q8BMJ8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sp8Q8BMJ8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sp8Q8BMJ8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms