Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gga3Q8BMI3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gga3Q8BMI3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gga3Q8BMI3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms