Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rufy1Q8BIJ7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy1Q8BIJ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy1Q8BIJ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms