Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnf41Q8BH75 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf41Q8BH75 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf41Q8BH75 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms