Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Susd4Q8BH32 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Susd4Q8BH32 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Susd4Q8BH32 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms