Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN9

Uncharacterized protein C1orf115 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGN9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGN9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8BGN9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q8BGN9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8BGN9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGN9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8BGN9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGN9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGN9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8BGN9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8BGN9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8BGN9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8BGN9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BGN9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8BGN9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms