Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U2af1l4Q8BGJ9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U2af1l4Q8BGJ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2af1l4Q8BGJ9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2af1l4Q8BGJ9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms