Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc17a8Q8BFU8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a8Q8BFU8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc17a8Q8BFU8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms