Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M10.4Q85ZW8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms