Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem39bQ810L4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem39bQ810L4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms