Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChfrQ810L3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChfrQ810L3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChfrQ810L3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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