Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amigo1Q80ZD8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Amigo1Q80ZD8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amigo1Q80ZD8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms