Protein–RNA interactions for Protein: Q80YV4

Pank4, Pantothenate kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pank4Q80YV4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pank4Q80YV4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pank4Q80YV4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pank4Q80YV4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pank4Q80YV4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pank4Q80YV4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pank4Q80YV4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pank4Q80YV4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pank4Q80YV4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pank4Q80YV4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pank4Q80YV4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pank4Q80YV4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pank4Q80YV4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pank4Q80YV4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pank4Q80YV4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms