Protein–RNA interactions for Protein: Q80WR1

Tspan18, Tetraspanin-18, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan18Q80WR1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Tspan18Q80WR1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Tspan18Q80WR1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Tspan18Q80WR1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Tspan18Q80WR1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Tspan18Q80WR1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Tspan18Q80WR1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan18Q80WR1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Tspan18Q80WR1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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Tspan18Q80WR1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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Tspan18Q80WR1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Tspan18Q80WR1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan18Q80WR1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Tspan18Q80WR1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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