Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Otop3Q80UF9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otop3Q80UF9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otop3Q80UF9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms