Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cep170bQ80U49 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cep170bQ80U49 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cep170bQ80U49 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms