Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lca5Q80ST9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lca5Q80ST9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lca5Q80ST9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms