Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo1Q7TT28 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rexo1Q7TT28 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rexo1Q7TT28 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.3 ms