Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Atf7ipQ7TT18 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atf7ipQ7TT18 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf7ipQ7TT18 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms