Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ClmQ7TSN2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ClmQ7TSN2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ClmQ7TSN2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms