Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctdp1Q7TSG2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctdp1Q7TSG2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctdp1Q7TSG2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms