Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmc3Q7TQ69 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc3Q7TQ69 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc3Q7TQ69 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms