Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
1700010I14RikQ7TPG0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
1700010I14RikQ7TPG0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700010I14RikQ7TPG0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms