Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpf1Q7TND5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpf1Q7TND5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpf1Q7TND5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms