Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf139Q7TMV1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf139Q7TMV1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms