Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ScocQ78YZ6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ScocQ78YZ6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ScocQ78YZ6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms