Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcl2Q78Y63 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcl2Q78Y63 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcl2Q78Y63 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms