Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usmg5Q78IK2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usmg5Q78IK2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usmg5Q78IK2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms