Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GypcQ78HU7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GypcQ78HU7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GypcQ78HU7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GypcQ78HU7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GypcQ78HU7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GypcQ78HU7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GypcQ78HU7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GypcQ78HU7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GypcQ78HU7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GypcQ78HU7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GypcQ78HU7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms