Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smg5Q6ZPY2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smg5Q6ZPY2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms