Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnt1Q6ZPR4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnt1Q6ZPR4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnt1Q6ZPR4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms