Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc44a1Q6X893 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc44a1Q6X893 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc44a1Q6X893 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc44a1Q6X893 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms