Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gja6Q6S5G4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gja6Q6S5G4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gja6Q6S5G4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms