Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt9Q6RHW0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt9Q6RHW0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt9Q6RHW0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms