Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2b4Q6Q477 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2b4Q6Q477 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2b4Q6Q477 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms