Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp1a2Q6PIE5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp1a2Q6PIE5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1a2Q6PIE5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms