Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmeff1Q6PFE7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmeff1Q6PFE7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmeff1Q6PFE7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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