Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nup98Q6PFD9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup98Q6PFD9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup98Q6PFD9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms