Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PdgfrlQ6PE55 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfrlQ6PE55 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfrlQ6PE55 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 241.4 ms