Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarcc2Q6PDG5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcc2Q6PDG5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcc2Q6PDG5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc2Q6PDG5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms