Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atl2Q6PA06 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atl2Q6PA06 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atl2Q6PA06 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms