Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmd5Q6P5H6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frmd5Q6P5H6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frmd5Q6P5H6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms