Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NesQ6P5H2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NesQ6P5H2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms