Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vsig8Q6P3A4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig8Q6P3A4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms