Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp4r3aQ6P2K6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms