Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac4Q6NZM9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac4Q6NZM9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms